• Université Lyon1
• UMR CNRS 5280
• 5 rue de la Doua
• 69100 Villeurbanne
• Contact : isabelle.krimm@univ-lyon1.fr
• Site Internet : http://fragmentech.univ-lyon1.fr/

Responsable

Isabelle Krimm

Thématique principale

Nous utilisons les molécules fragments comme outils chimiques  innovants:

Pour la chimie-biologie, afin de mieux comprendre les structures des protéines, leur dynamique et leurs fonctions, et d'analyser et d'inhiber les interactions protéine-protéine

Pour le Drug Design contre les enzymes et les interactions protéine-protéine.

Nous utilisons La RMN:
Pour le criblage de fragment, afin d'identifier et valider des fragments "touches".

Pour l'analyse structurale de complexes protéine-fragment, afin d'identifier les interactions clés responsables de la reconnaissance protéine-protéine et comparer des fragments analogues

Techniques spécifiques

RMN

Systemes de détection

RMN

Equipements particuliers

RMN 600 MHz Agilent

Taille de la chimiothèque

< 1000 molécules

Affiliation

CNRS, Université de Lyon

Personnes associées

• Cala Olivier
• Krimm Isabelle

Brevets / Publications / Communications

BcL-xL conformational changes upon fragment binding revealed by NMR.
Aguirre C, Ten Brink T, Walker O, Guillière F, Davesne D, Krimm I.
PLoS One. 2013 May 23;8(5):e64400

NMR-based analysis of protein-ligand interactions.
Cala O, Guillière F, Krimm I.
Anal Bioanal Chem. 2013 Apr 18

INPHARMA-based identication of ligand binding site in fragment-based drug design.
Krimm I.
Med. Chem. Commun. (2012), 3, 605-610

Krimm I, Lancelin JM, Praly JP.
J Med Chem. 2012 Feb 9;55(3):1287-95

Ligand specificity, privileged substructures and protein druggability from fragment-based screening.
Barelier S, Krimm I.
Curr Opin Chem Biol. 2011 Aug;15(4):469-74.

Ligand specificity in fragment-based drug design.
Barelier S, Pons J, Gehring K, Lancelin JM, Krimm I.
J Med Chem. 2010 Jul 22;53(14):5256-66

Discovery of fragment molecules that bind the human peroxiredoxin 5 active site.
Barelier S, Linard D, Pons J, Clippe A, Knoops B, Lancelin JM, Krimm I.
PLoS One. 2010 Mar 17;5(3):e9744

Fragment-based deconstruction of Bcl-xL inhibitors.
Barelier S, Pons J, Marcillat O, Lancelin JM, Krimm I.
J Med Chem. 2010 Mar 25;53(6):2577-88

NMR screening applied to the fragment-based generation of inhibitors of creatine kinase exploiting a new interaction proximate to the ATP binding site.
Bretonnet AS, Jochum A, Walker O, Krimm I, Goekjian P, Marcillat O, Lancelin JM.
J Med Chem. 2007 Apr 19;50(8):1865-75